A Pós-Graduação no Ifal configura-se como um dos eixos fundamentais para o desenvolvimento científico da Instituição. Os cursos de pós-graduação, lato e stricto sensu são ofertados em diversos campi do Estado, oferecidos de forma gratuita, em ambientes tecnológicos de ensino e pesquisa, voltados para a formação de pesquisadores atentos ao desenvolvimento do pensamento científico, ao saber tecnológico, ao compromisso ambiental e à consciência cidadã.

Os princípios que norteiam os cursos de pós-graduação propostos pelo Ifal são a verticalização do ensino, a integração com os demais níveis de ensino e com a pesquisa e a extensão, o fortalecimento da pesquisa e inovação, a consolidação da política de publicação, o desenvolvimento local e regional e o compromisso socioambiental.